57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0887 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1021    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  24.37 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  29.02 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  27.23 
 
 		 449 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  27.19 
 
 		 381 aa  153  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 651 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  25 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  31.05 
 
 		 318 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  27.18 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  29.37 
 
 		 356 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  25.16 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  24.35 
 
 		 393 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.71 
 
 		 906 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  31.7 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  25.26 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  34.39 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  22.41 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  31.91 
 
 		 380 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  24.32 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  23.52 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  22.9 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  23.08 
 
 		 307 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  23.35 
 
 		 331 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.89 
 
 		 639 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  32.37 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  22.97 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  23.63 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  25.85 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1023 aa  80.5  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  26.72 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  28.12 
 
 		 491 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  33.33 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  21.1 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.26 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  23.08 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  24.23 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  34.57 
 
 		 89 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1075 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1143 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.24 
 
 		 107 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  23.79 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  37.21 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  21.49 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  31.5 
 
 		 209 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  20.62 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  20.06 
 
 		 850 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  23.53 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  22.92 
 
 		 554 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  46.43 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  22.12 
 
 		 385 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  35.09 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  22.98 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  27.91 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  23.04 
 
 		 568 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>