31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3541 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  59.76 
 
 		 1075 aa  1111    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1143 aa  2188    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  33.25 
 
 		 327 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  33.48 
 
 		 318 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  27.11 
 
 		 347 aa  91.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  22.63 
 
 		 449 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  28.37 
 
 		 356 aa  88.6  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  28.51 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  30.95 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0315  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 170 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 651 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  29.41 
 
 		 340 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.87 
 
 		 906 aa  73.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  26.16 
 
 		 696 aa  73.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  24.8 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.83 
 
 		 373 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  26.21 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  24.26 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.8 
 
 		 512 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.66 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  36 
 
 		 554 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  25.66 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  60.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  22.71 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  24.45 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  28.33 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  28.93 
 
 		 260 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  23 
 
 		 337 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  30.37 
 
 		 639 aa  45.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>