39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4154 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 1143 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 1075 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  25.18 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 651 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  29.23 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  24.03 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.68 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  30.16 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.09 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  25.32 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  26.72 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  27.91 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  24.18 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  25.85 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  26.76 
 
 		 696 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  27.41 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.53 
 
 		 515 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  32.14 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  32.98 
 
 		 426 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  27.66 
 
 		 507 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  34.94 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.91 
 
 		 906 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  30.77 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  23.75 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.37 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.52 
 
 		 636 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  29.46 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  32.26 
 
 		 904 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  26.09 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  24.49 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.69 
 
 		 850 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  36.21 
 
 		 385 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.24 
 
 		 665 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  35.71 
 
 		 107 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>