41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1339 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  100 
 
 		 342 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  35.62 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  40 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  47.73 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  43.01 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  40 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  37.3 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  33.06 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  33.56 
 
 		 696 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  41.76 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  42.7 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  37 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  41.03 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 651 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  42.05 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  34.86 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  36.84 
 
 		 507 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  31.93 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  35.11 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  38.2 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.42 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  32.5 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1023 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  37.21 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.69 
 
 		 491 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  30.43 
 
 		 181 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  31.82 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  30.43 
 
 		 522 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  25.7 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  34.38 
 
 		 107 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  35.9 
 
 		 639 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  27.36 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  34.07 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  37.1 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  31.25 
 
 		 665 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  30 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  35.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2387  KWG repeat protein  40.43 
 
 		 68 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000779231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3308  KWG repeat protein  30.19 
 
 		 512 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>