53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0883 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  348  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  36.61 
 
 		 347 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  35.71 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  35.4 
 
 		 449 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  38.78 
 
 		 356 aa  81.3  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  34.69 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  41.84 
 
 		 404 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  28.95 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 651 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 433 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  39.18 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  35.71 
 
 		 696 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  35.4 
 
 		 381 aa  72  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  39.81 
 
 		 380 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  38.54 
 
 		 906 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  40.7 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  31.58 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  43.01 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  35.96 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  31.36 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  41.33 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  29.92 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  31.5 
 
 		 512 aa  64.3  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  32.35 
 
 		 522 aa  64.3  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.08 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  31.93 
 
 		 551 aa  60.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  38.2 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  32.97 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  31.46 
 
 		 639 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1023 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  32.35 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  41.43 
 
 		 665 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  35.79 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  30.43 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  30.39 
 
 		 453 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  36.84 
 
 		 426 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  35.53 
 
 		 307 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  30.19 
 
 		 331 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  31.17 
 
 		 636 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  22.94 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1143 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  26.32 
 
 		 327 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.45 
 
 		 850 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  26 
 
 		 583 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1075 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  30.43 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.33 
 
 		 636 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  31.19 
 
 		 568 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  30.85 
 
 		 564 aa  41.6  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4076  hypothetical protein  33.77 
 
 		 269 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>