41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1085 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  877    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  40.9 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  39.42 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 651 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  25.61 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  27.78 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  24.14 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  22.04 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  25.4 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  24.61 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  23.11 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  26.18 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  49.06 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  24.33 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  36.84 
 
 		 181 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  28.14 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  26.61 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  22.97 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  36.99 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 1075 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  20.85 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  35.09 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  22.18 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  32.98 
 
 		 327 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  23.23 
 
 		 665 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  24.27 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  26.14 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1143 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  32.93 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  21.66 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  22.89 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  24.9 
 
 		 320 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  40 
 
 		 260 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.62 
 
 		 107 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1023 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  35.19 
 
 		 89 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  23.17 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.69 
 
 		 906 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  28.75 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>