59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3778 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  100 
 
 
320 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  38.36 
 
 
356 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  33.81 
 
 
449 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  36.27 
 
 
347 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  33.93 
 
 
318 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  32.91 
 
 
340 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 
651 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  31.71 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  31.86 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  31.41 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  32.91 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  31.08 
 
 
404 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  34.06 
 
 
297 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  30.47 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  31.17 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  29.35 
 
 
696 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  28.57 
 
 
551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.69 
 
 
491 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  24.32 
 
 
515 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.27 
 
 
906 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  26.74 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  46.02 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  29.35 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  28.05 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  33.96 
 
 
260 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  27.04 
 
 
1023 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  32.24 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.15 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  37.3 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  34.71 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  39.34 
 
 
461 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  22.89 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.59 
 
 
639 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  35.96 
 
 
181 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.46 
 
 
665 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  25.57 
 
 
636 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  47.54 
 
 
107 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  22.87 
 
 
583 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  38.2 
 
 
89 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1143 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  31.45 
 
 
158 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
1075 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  26.78 
 
 
453 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  25.93 
 
 
209 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.38 
 
 
850 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  31.68 
 
 
522 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  24.6 
 
 
564 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  21.34 
 
 
385 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  23.29 
 
 
568 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 
636 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  22.89 
 
 
565 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  26.29 
 
 
904 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2387  KWG repeat protein  38.89 
 
 
68 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000779231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  20.97 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  30.95 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  26.13 
 
 
554 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  26.09 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  40.82 
 
 
426 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  34.92 
 
 
414 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>