14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2396 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2396  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2891  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.69 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1023 aa  51.2  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  30.77 
 
 		 318 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1650  hypothetical protein  29.41 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  25.62 
 
 		 381 aa  45.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.95 
 
 		 347 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1932  hypothetical protein  26.73 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0326213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  45.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  31.36 
 
 		 449 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  37.33 
 
 		 356 aa  42  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  33.33 
 
 		 551 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  30.1 
 
 		 316 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>