30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3654 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3654  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  897    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2247  hypothetical protein  37.62 
 
 		 608 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6706  hypothetical protein  38.99 
 
 		 488 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4264  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.9 
 
 		 636 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00811307  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4141  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 		 782 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2302  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  30.4 
 
 		 692 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 691 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 570 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.57 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  28.46 
 
 		 1100 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 585 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 577 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  30.38 
 
 		 667 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.51 
 
 		 1076 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 536 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  33.33 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 571 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.51 
 
 		 1072 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  24.76 
 
 		 736 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 615 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.37 
 
 		 715 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 982 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 		 601 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 690 aa  43.5  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.43 
 
 		 951 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>