66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2877 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  74.68 
 
 		 236 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  56.52 
 
 		 234 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  56.52 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  56.09 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  40.27 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  38.96 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  37.78 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  38.22 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  37.89 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  35.71 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  37.5 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  36.89 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  39.29 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  35.84 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  34.63 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  35.84 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  35.5 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  33.47 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  35.32 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  32.88 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  33.78 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  31.7 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.65 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.74 
 
 		 461 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  31.9 
 
 		 283 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  32.58 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  28.96 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  33.76 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  29.52 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  31.14 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  32.99 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  31.06 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.44 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  30.41 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  30.3 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  28.03 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  30.04 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  27.27 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  28.63 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.75 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.75 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  28.63 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  30.05 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  28.88 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  28.94 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  30.53 
 
 		 380 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.64 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  23.91 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  27.45 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  28.63 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  29.41 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  29.13 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  25.84 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  30 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.48 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.2 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  27.59 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  26.14 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  27.7 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  24.44 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  29.81 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  30.85 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  28.57 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  24.77 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>