61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1851 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  47.74 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  42.45 
 
 
242 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  41.15 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  41.08 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  39.42 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  40.57 
 
 
240 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  39 
 
 
240 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  39.42 
 
 
240 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  39 
 
 
240 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  37.8 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  37.6 
 
 
243 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  36.21 
 
 
240 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  34.87 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  35.47 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  33.05 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  29.88 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  28.4 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  30.13 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  32.13 
 
 
245 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  29.17 
 
 
244 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.54 
 
 
242 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31.95 
 
 
238 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.71 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  28.81 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  27.76 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.68 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.11 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.57 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  26.18 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  25.33 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.38 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  28.87 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.35 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  24.89 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  22.75 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  24.46 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.03 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  29.23 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  28.33 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  24.48 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.24 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  25 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  26.14 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  24.31 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.63 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.56 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  21.43 
 
 
461 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.52 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  24.27 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  21.76 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  21.85 
 
 
234 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.8 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  33.33 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  21.85 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  21.85 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  27.83 
 
 
255 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  21.3 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  23.28 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.03 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>