66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1210 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  100 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  62.03 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  60.59 
 
 
238 aa  310  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  58.05 
 
 
239 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  35.19 
 
 
233 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  36.82 
 
 
230 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  38.5 
 
 
233 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  34.78 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  34.35 
 
 
234 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  34.35 
 
 
234 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  33.91 
 
 
244 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  36.28 
 
 
236 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  31.74 
 
 
229 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  30.74 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  32.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  30.47 
 
 
241 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  30 
 
 
228 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  32.34 
 
 
236 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  30.74 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  28.45 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  26.18 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.2 
 
 
264 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  28.7 
 
 
264 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.13 
 
 
242 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.07 
 
 
283 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  27.78 
 
 
244 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.47 
 
 
237 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  29.82 
 
 
255 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.71 
 
 
255 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  28.63 
 
 
233 aa  99  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  30.39 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  27.16 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  30.73 
 
 
461 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  28.94 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  26.18 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.16 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.9 
 
 
266 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  27.86 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.02 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.9 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.35 
 
 
264 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  29.47 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  26.02 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  26.47 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.38 
 
 
273 aa  82  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  30.62 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  27.31 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.7 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.68 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  29.56 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  26.89 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  24.37 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  26.47 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.85 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  25.87 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  26.89 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  24.55 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  24.27 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  25 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  21.84 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  23.11 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.05 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  25.12 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  27.16 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.13 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>