60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2408 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  31.56 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.76 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  34.22 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  33.49 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  30.51 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  32.76 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  30.6 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  32.16 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.88 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  29.31 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  33.33 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  29.31 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  29.31 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.18 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.06 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  32.61 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  28.57 
 
 		 257 aa  98.2  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  32.61 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.77 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  26.6 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  30.54 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  33.82 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.32 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.79 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  27.5 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  30.05 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  28.33 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  27.8 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  26.11 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  29.27 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  26.83 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.27 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  29.66 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.79 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.11 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  27.68 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  27.23 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  27.23 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  29.13 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.64 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  27.09 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.57 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.92 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.7 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.82 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  23.87 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.88 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26.24 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.35 
 
 		 461 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  25.69 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.88 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  26.6 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.44 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.11 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  26.32 
 
 		 259 aa  45.1  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  22.27 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  23.53 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>