59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3736 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  45.38 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  46.91 
 
 
242 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  44.73 
 
 
240 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  44.3 
 
 
240 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  44.3 
 
 
240 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  43.88 
 
 
240 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  46.84 
 
 
240 aa  222  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  41.6 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  44.49 
 
 
238 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  42.5 
 
 
240 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  42.86 
 
 
233 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  39.24 
 
 
238 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  35.8 
 
 
264 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  37.6 
 
 
242 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  36.32 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  32.77 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.75 
 
 
238 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.9 
 
 
244 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.67 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  31.52 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  32.64 
 
 
242 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  28.16 
 
 
236 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  32.43 
 
 
264 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  27.9 
 
 
244 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25.52 
 
 
259 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.71 
 
 
258 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  27.43 
 
 
233 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  26.84 
 
 
256 aa  99  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.96 
 
 
233 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  27.63 
 
 
230 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  24.79 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  26.07 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  25.31 
 
 
245 aa  89  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  26.84 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  23.81 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.52 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.84 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  24.67 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  23.24 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  25.44 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.32 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  25.42 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  25 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  25 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  24.49 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  24.03 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  21.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  22.61 
 
 
461 aa  65.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.87 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  22.03 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  20.59 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  21.84 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.31 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  23.01 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  24.24 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  22.78 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  23.18 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  21.68 
 
 
380 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>