59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02200 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  47.74 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  42.37 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  38.02 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  39.24 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  39.66 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  35.8 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  39.24 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  38.91 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  38.82 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  37.96 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  38.91 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  37.14 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  31.78 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.58 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  35.54 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.88 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  29.46 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.49 
 
 		 244 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.92 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  29.83 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  27.94 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  28.26 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.42 
 
 		 238 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.08 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  28.33 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  26.42 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  29.33 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.9 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  29.91 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  24.63 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  23.27 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  29.31 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  23.87 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  23.38 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.45 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  23.93 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  22.98 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  24.66 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  25 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.44 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  26.24 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  22.27 
 
 		 228 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  25.82 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  25.82 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  25.35 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  26.73 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  25.76 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.8 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  23.5 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  29.18 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.42 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  26.2 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.71 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  23.53 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.2 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>