65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0240 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  44.26 
 
 
244 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  41.42 
 
 
241 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  43.33 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  33.61 
 
 
244 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  33.05 
 
 
240 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  30.67 
 
 
259 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  33.47 
 
 
240 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  33.05 
 
 
240 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  33.05 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  34.58 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.19 
 
 
238 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  33.33 
 
 
240 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  31.2 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  29.18 
 
 
258 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  31.4 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  31.67 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  29.58 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  30.96 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  30.96 
 
 
233 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  31.2 
 
 
233 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  35.5 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  32.81 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  34.03 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  31.49 
 
 
235 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  29.71 
 
 
239 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  31.58 
 
 
230 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  29.96 
 
 
242 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  29.8 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  29.31 
 
 
238 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  28.4 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  31.76 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  31.09 
 
 
264 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  33.04 
 
 
234 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  32.61 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  26.78 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  27.62 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  32.61 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  32.76 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  28.05 
 
 
239 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.77 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  27.27 
 
 
240 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.36 
 
 
229 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  29.46 
 
 
238 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  31 
 
 
266 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.9 
 
 
237 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  29.96 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.59 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  28.81 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.1 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  24.58 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.76 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  22.84 
 
 
461 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.76 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.33 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.54 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  27.12 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  27.83 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  24.89 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.87 
 
 
264 aa  72  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.79 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.16 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  26.7 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  21.86 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  21.26 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>