63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1261 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1261  VCBS  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.89 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  36.89 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  35.6 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  35.25 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  34.84 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  35.25 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  34.69 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  34.57 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  32.81 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  31.35 
 
 		 233 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  31.02 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  31.52 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.84 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  35.9 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.04 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  30.38 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  32.47 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  35.26 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.51 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  28.51 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.82 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  30.54 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  25.68 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  27.94 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25.6 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  32.66 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  28.06 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25.4 
 
 		 233 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  32.99 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  27.71 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  27.76 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  30.43 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  29.06 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.86 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  29.74 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.65 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.32 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.96 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  23.79 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  28.5 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  27.5 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.24 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  24.24 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  25.62 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25.25 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  23.9 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.58 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  26.73 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  25.88 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.73 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  23.04 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.63 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.1 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  23.65 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  22.11 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.6 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  26.74 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  24.73 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  23.7 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  24.4 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>