65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03901 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  44.26 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  44.44 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  44.13 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  38.89 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  38.03 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  36.48 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  36.91 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  35.62 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  36.05 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  34.76 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  35.53 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  33.91 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  35.19 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  31.9 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  34.21 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  29.49 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  33.49 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.64 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  32.31 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  32.44 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  35.22 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.33 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  35.9 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  30.34 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  31.36 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  31.91 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  31.49 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.78 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  29.82 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  29.57 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  29.13 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  26.52 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  31.88 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  29.17 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  33.03 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  28.82 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  32.57 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  32.11 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  31.88 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  29.95 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  31.65 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  30.34 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.78 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  31.65 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.86 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.57 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.03 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  31.17 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.27 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.63 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  27.27 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.61 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  24.37 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26.36 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.18 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.56 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.56 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.84 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  23.25 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  24.32 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  23.45 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  24.47 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  24.55 
 
 		 380 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>