63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1178 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  100 
 
 		 240 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  98.75 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  97.5 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  94.17 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  72.5 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  71.97 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  57.74 
 
 		 244 aa  286  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  48.95 
 
 		 242 aa  241  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  44.3 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  43.04 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  41 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  41.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  42.8 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  39.66 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  39.42 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  39.92 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  35.83 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  36.05 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.05 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  35.62 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  34.84 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  33.99 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.49 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.25 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.47 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.47 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.35 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.76 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.8 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  29.96 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  30.37 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.15 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.33 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  29.11 
 
 		 273 aa  91.7  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  33.16 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.75 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  30.5 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  31.58 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.36 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  29.85 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.86 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.63 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  28.33 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.7 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  26.07 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.47 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  26.22 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  28.93 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  27.73 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.21 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.44 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28.43 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  27.92 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.84 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.33 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.05 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  24.89 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  26.37 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.67 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  21.05 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.55 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  24.12 
 
 		 259 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>