66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1102 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  43.35 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  42.8 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  42.37 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  42.37 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  41.95 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  41.53 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  40.43 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  36.32 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  36.21 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  37.93 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  35.17 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  36.09 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.49 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  32.9 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  36.91 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  35.47 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  34.22 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  35.22 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  35.26 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  31.06 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.56 
 
 		 256 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.35 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.96 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  29.86 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  31.03 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  29.83 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  28.27 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.41 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  26.64 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  31.44 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  29.17 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  32.4 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.68 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.99 
 
 		 266 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  28.11 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  28.44 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.91 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  27.65 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  26.79 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.05 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  27.72 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25.73 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.94 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.92 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  31.22 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  26.64 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  27.78 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.54 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  26.7 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.96 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  27.16 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  25.32 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  26.54 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  28.88 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  23.35 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  25.9 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  28.42 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.25 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.74 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  26.2 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.2 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  23.25 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>