62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0916 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0916  SapC  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  51.88 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  39.24 
 
 
243 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  44.16 
 
 
233 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  39.15 
 
 
242 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  35.39 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  35.44 
 
 
238 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  36.25 
 
 
240 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  35 
 
 
240 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  35.83 
 
 
240 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  36.25 
 
 
240 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  35.83 
 
 
240 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  34.44 
 
 
240 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  37.14 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  31.58 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  33.05 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  32.33 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  31.06 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  29.95 
 
 
244 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  30.94 
 
 
258 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.46 
 
 
242 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.12 
 
 
242 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  26.05 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  28.51 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  28.06 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25.13 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.39 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  26.79 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.43 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.38 
 
 
264 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  25 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.46 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30.05 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.43 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.32 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.88 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  25.12 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.94 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.92 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.55 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  24.66 
 
 
229 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  25.27 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.32 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.32 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  23.85 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  24.89 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  29.03 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  25.13 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.32 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  26.05 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  22.61 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  24.23 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.14 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  25.42 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  25 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.79 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  23.79 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  22.57 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  25.64 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.63 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.35 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  24.09 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>