56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0596 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  100 
 
 
261 aa  541  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  43.75 
 
 
264 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.66 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  33.33 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  31.28 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.86 
 
 
273 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  31.52 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.21 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  33.33 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  28.76 
 
 
264 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.57 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  29.06 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  28.4 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  31.93 
 
 
251 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  31.47 
 
 
255 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  26.38 
 
 
244 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.58 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  24.9 
 
 
461 aa  88.6  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  25.74 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  28.98 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  28.76 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  25.31 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  27.78 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  30.5 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  27.83 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  25.65 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  28.64 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  24.11 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.7 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  21.9 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  22.41 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  23.04 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  23.56 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  21.74 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  23.89 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.57 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  24.64 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  22.32 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  25 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  23.08 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.46 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  22.55 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  22.13 
 
 
234 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  22.36 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  24.73 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  23.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  22.78 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  23.08 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  23.68 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  22.96 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.54 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  22.7 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  21.5 
 
 
380 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>