62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02804 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02804  SapC  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  44.58 
 
 
240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  43.7 
 
 
242 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  43.46 
 
 
240 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  43.46 
 
 
240 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  41.74 
 
 
244 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  43.04 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  41.42 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  43.04 
 
 
240 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  42.86 
 
 
243 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  47.48 
 
 
240 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  44.16 
 
 
238 aa  178  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  41.08 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  38.91 
 
 
264 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  34.05 
 
 
241 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  37.93 
 
 
235 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  30.96 
 
 
242 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  34.06 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  36.17 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  31.35 
 
 
257 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.91 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  30.22 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31.33 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  30.13 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  30.91 
 
 
230 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.82 
 
 
244 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  26.69 
 
 
259 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  27.47 
 
 
236 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  27.04 
 
 
233 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.29 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  30.35 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  29.79 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  32.8 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  31.3 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  28.63 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  23.4 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  25.43 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  32.62 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  24.14 
 
 
240 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  29.44 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.46 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  23.95 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  28.86 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.27 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.91 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  26.87 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  31.03 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.47 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  28.64 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  27.07 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  27.07 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.64 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  24.47 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  31.12 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  21.98 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  23.63 
 
 
461 aa  62.4  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.35 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.57 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  25.1 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  21.24 
 
 
380 aa  52.4  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.96 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>