64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1399 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  44.49 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  42.24 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  41.38 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  40.95 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  40.95 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  42.8 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  39.92 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  40.09 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  38.36 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  41.3 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  36.44 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  35.44 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  31.78 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  34.87 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  32.9 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  32.33 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  28.63 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.31 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  27.97 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  27.82 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  29.13 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  27.93 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  28.05 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  33.68 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  28.07 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  28.15 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  27.31 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  26.55 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  28.45 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.56 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  28.76 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.59 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.47 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.47 
 
 		 266 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.16 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.71 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.32 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  26.75 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  27.47 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.5 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25.21 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.45 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  29.13 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.56 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  25.54 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.2 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  24.32 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  29.17 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  24.68 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  28.03 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  27.14 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.52 
 
 		 461 aa  62  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.32 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  25.96 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  25.84 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  24.79 
 
 		 380 aa  57  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.21 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26.02 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.63 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.08 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25.32 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>