55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1289 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1289  SapC  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  64.26 
 
 
259 aa  347  9e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  60.48 
 
 
258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  37.28 
 
 
264 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  32.93 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  33.33 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  32.33 
 
 
237 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  32.47 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.68 
 
 
266 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  30.04 
 
 
255 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  32.63 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.51 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  32.65 
 
 
264 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  28.94 
 
 
264 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  29.87 
 
 
240 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.14 
 
 
461 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.03 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  31.44 
 
 
230 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  26.64 
 
 
242 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.33 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  25.74 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  30.7 
 
 
283 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.61 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  26.75 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  26 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  25.1 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.01 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.95 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  27.12 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.47 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25.11 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.03 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  28.51 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.66 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  25.11 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  25.56 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  24.12 
 
 
229 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  24.37 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  23.68 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  26.05 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  23.95 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  27.19 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.95 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  28.95 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  24 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  27.75 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.26 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  25.96 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  23.7 
 
 
257 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  25.77 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.42 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  24.55 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  24.12 
 
 
240 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>