66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2392 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  41.42 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  44.44 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  45.3 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  39.08 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  35.29 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  38.77 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  36.02 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  36.91 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  36.02 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  36.05 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  34.05 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  35.04 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  35.59 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  32.63 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  29.69 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  34.08 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  35.17 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  33.62 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  32.02 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  32.77 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  35.6 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  31.6 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  33.48 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  32.17 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.74 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  31.58 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  33.48 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  29.46 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  35.32 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.08 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  31.2 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  28.63 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  31.88 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  33.49 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  30.94 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.69 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  32.91 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  31.56 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  32.48 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  29.88 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  32.05 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.61 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  30.47 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  30.87 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.35 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.49 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.45 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.45 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.63 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.19 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  30.5 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.23 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  29.24 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.7 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.97 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  25.42 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.54 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  27.78 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  27.56 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  30.5 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  26.24 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.11 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  20.92 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  26.19 
 
 		 380 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>