66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2202 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  49.37 
 
 
244 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  37.83 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  36.84 
 
 
256 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  33.77 
 
 
283 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  37.92 
 
 
264 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  35.71 
 
 
233 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  36.91 
 
 
266 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  33.91 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  34.19 
 
 
234 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  34.06 
 
 
233 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  32.46 
 
 
259 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  36.91 
 
 
266 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  33.76 
 
 
234 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  33.76 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  33.19 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  33.94 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  30.47 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  31.88 
 
 
230 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  33.91 
 
 
237 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  31.38 
 
 
264 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  29.69 
 
 
241 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  30.93 
 
 
242 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  32.93 
 
 
255 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  33.33 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  29.49 
 
 
239 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  33.75 
 
 
255 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  29.83 
 
 
273 aa  118  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  30.09 
 
 
228 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.09 
 
 
242 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  28 
 
 
229 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  28.76 
 
 
261 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  32.43 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  28.32 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.45 
 
 
240 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  29.96 
 
 
258 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.86 
 
 
240 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  28.94 
 
 
259 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  27.73 
 
 
244 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  28.07 
 
 
238 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.64 
 
 
461 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  29.46 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  32.8 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  29.03 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  26.92 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  29.65 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  27.8 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  30.5 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  29.81 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  30.5 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  29.24 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.22 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  29.5 
 
 
240 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.5 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  29.38 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  27.95 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  24.09 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  30 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  22.65 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  26.18 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  23.79 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  22.73 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  26.24 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  25.27 
 
 
225 aa  72  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  28.99 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  24.55 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>