65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1142 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  74.06 
 
 		 240 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  72.38 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  72.38 
 
 		 240 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  71.97 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  72.38 
 
 		 240 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  56.07 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  48.95 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  46.84 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  44.58 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  42.74 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  43.35 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  38.91 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  38.36 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  40.57 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  39.08 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  34.44 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  38.24 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  35.19 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  34.69 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  31.12 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  32.08 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  31.76 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.38 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  31.33 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  29.39 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  28.63 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  27 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  32.49 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  30.17 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  29.41 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  29.26 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  28.5 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  31.41 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30.3 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.43 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.5 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.37 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.83 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  27.86 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.2 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.15 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.35 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.27 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  26.58 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.74 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26 
 
 		 264 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.21 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  29.26 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28.82 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  28.38 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  27.23 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.64 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  24.64 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.98 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  25.48 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.08 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  29.26 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.68 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.23 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25.74 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  21.12 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>