65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2701 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2701  SapC  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  74.68 
 
 		 233 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  54.35 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  53.91 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  53.48 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  41.59 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  39.82 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  35.16 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  38.05 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  33.77 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  35.27 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.94 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  35.65 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  34.07 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  34.51 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  33.04 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  37.56 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  33.18 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  32.76 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.46 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  30.49 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  32.16 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  31.22 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.39 
 
 		 461 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  30.22 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.65 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  32.29 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  30.17 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  32.13 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  30.21 
 
 		 283 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  30.64 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.77 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  29.61 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  30.96 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  25.44 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.48 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  28.12 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.06 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.93 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.74 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.71 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  30.95 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  30.08 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  29.47 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  32.37 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  28.03 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  25.88 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  23.98 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  26.73 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  27 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  24.89 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  27.73 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  29.7 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  27.73 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  29.44 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  30.7 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.44 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  29.7 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.42 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  24.64 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  25.32 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  24.14 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  29.7 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  23.81 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>