58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0917 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.46 
 
 
244 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  28.87 
 
 
255 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.42 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  28.74 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  27.8 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.21 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  28.98 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.73 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  28.21 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.94 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  30.38 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.2 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  24.69 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  24.47 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  26.05 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  29.25 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.03 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  26.38 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.96 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  28.39 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25.61 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  25 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  22.84 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  20.92 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.11 
 
 
461 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  22.31 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  24.44 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  25.48 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.85 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  25.25 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  22.27 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.22 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  24.89 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  21.86 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  22.91 
 
 
229 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  21.37 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  24.23 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  24.63 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.45 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  21.89 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  21.78 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  24.67 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  22.51 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  20.94 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  20.94 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  24.67 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  24.24 
 
 
380 aa  48.9  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  21.43 
 
 
239 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  23.81 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.53 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  23.01 
 
 
229 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  22.03 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  25 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  21.89 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  24.2 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  21.15 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>