63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3179 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  97.5 
 
 
240 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  93.33 
 
 
240 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  72.92 
 
 
240 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  72.38 
 
 
240 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  56.9 
 
 
244 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  49.37 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  44.3 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  43.46 
 
 
233 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  40.59 
 
 
240 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  40.95 
 
 
238 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  42.37 
 
 
235 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  39.24 
 
 
264 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  39 
 
 
242 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  39.92 
 
 
238 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  36.25 
 
 
238 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  36.02 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.05 
 
 
242 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  36.05 
 
 
244 aa  144  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  35.25 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  34.48 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  31.09 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.49 
 
 
244 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.13 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.9 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  31.11 
 
 
229 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.35 
 
 
258 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  28.16 
 
 
245 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  30.25 
 
 
229 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.46 
 
 
230 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  30.37 
 
 
225 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.33 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.33 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.96 
 
 
228 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  33.16 
 
 
266 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.69 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  31.94 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.5 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.35 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  28.57 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.86 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.88 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.6 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  27.85 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.64 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.89 
 
 
461 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  26.67 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  29.44 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.7 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.21 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.92 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  28.43 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28.93 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.84 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.33 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25.75 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.05 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25.87 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.23 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  21.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.08 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  24.55 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>