66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1114 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  100 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  56.12 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  58.05 
 
 		 239 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  54.89 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  40.27 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  41.59 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  36.84 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  34.76 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  34.35 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  36 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  35.56 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  35.11 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.19 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.74 
 
 		 229 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  33.19 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  33.48 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  29.71 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  33.91 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  32.62 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.71 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  30.74 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  31.33 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.36 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.58 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  31 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  30.89 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.38 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31.9 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  26.72 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.74 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.41 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.32 
 
 		 461 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.95 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  30.87 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.35 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  26.07 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  29.06 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.74 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.32 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  30.35 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  28.57 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  26.45 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.41 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  29.85 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  26.52 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  28.86 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  27.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  27.62 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  27.62 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  23.93 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  29.53 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  27.35 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  23.85 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.11 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.05 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  25 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  25.96 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.9 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  27.92 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  23.58 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  23.74 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  22.32 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  21.76 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  25.23 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  21.43 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>