58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0137 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  60.47 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  57.14 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  40 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  33.92 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  32.13 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.74 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  31.58 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  32.79 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  30.13 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  30.84 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.64 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.96 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  31.36 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  32.94 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  29.53 
 
 		 380 aa  92.8  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  27.59 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  32.47 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  24.26 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  26.69 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  28.07 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.03 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  26.05 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.79 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  32.23 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  32.37 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  30.5 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25.75 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.07 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  27.85 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  29.25 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  28.07 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  30.09 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  23.64 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  27.98 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  28.95 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  28.51 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28.51 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  25.88 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  26.79 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.71 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30.69 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  26.52 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  26.58 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  25.51 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  26.05 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  26.21 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.24 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  25.74 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  28.09 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  26.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  26.6 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  24.68 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.67 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.49 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  24.09 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>