63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2830 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  49.37 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  49.79 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  49.37 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  48.95 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  48.95 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  48.95 
 
 		 240 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  46.91 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  44.81 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  45.68 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  43.7 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  42.45 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  42.8 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  37.96 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  39.15 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  35.04 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.89 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  36.21 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  33.91 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.4 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  34.57 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  29.54 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  30.47 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  31.25 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  29 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.44 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.07 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  26.5 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  28.69 
 
 		 233 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  26.96 
 
 		 230 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  24.68 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  30.93 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.34 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.62 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  30.4 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.41 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  27.95 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  22.51 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.62 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  26.5 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  27.57 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.81 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  24.36 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  29.56 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  24.44 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.22 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  27.09 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.74 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.32 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  23.98 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  26.42 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  25.88 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  25.44 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.29 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  24.68 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  27.75 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.08 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  22.88 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  26.45 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  26.55 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>