55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1048 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1048  SapC  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  64.26 
 
 
259 aa  347  9e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  57.83 
 
 
258 aa  308  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  34.94 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  35.96 
 
 
264 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  31.28 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  33.61 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  32.74 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  31.36 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  32 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  30.57 
 
 
461 aa  109  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  30.22 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  31.47 
 
 
255 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  33.77 
 
 
264 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  29.39 
 
 
266 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.95 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.57 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.03 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  27.94 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  28.95 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.61 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.55 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  28.82 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  28.41 
 
 
380 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  23.85 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  29.41 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.21 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  27.23 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  26.81 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  23.61 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.81 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  24.77 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  28.14 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  27.46 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  28.26 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  26.24 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.57 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  27.16 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.7 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  28.21 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  25.11 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.61 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  25.11 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  26.73 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  24.32 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  25.45 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  25.64 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  25.1 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.45 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.63 
 
 
238 aa  52  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  24.07 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.88 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  25.36 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  27.23 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.55 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>