66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2408 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  91.73 
 
 		 266 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  53.44 
 
 		 255 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  38.66 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  34.93 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  36.91 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  33.76 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  33.47 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.27 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  31.54 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  31.52 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  28.68 
 
 		 259 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  31.44 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  31.39 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  31.78 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  30 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  30.24 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  29.34 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  28.45 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  29.39 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.7 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  30.32 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  29.26 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  28.89 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  31.98 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  30 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  29.86 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  28.86 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  27.83 
 
 		 461 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  33.16 
 
 		 240 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  33.16 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  33.16 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.47 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  30.34 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  33.16 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  26.84 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.95 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.23 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  33.51 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.65 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  30.37 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  30.46 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  26.41 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.47 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  29.91 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  25.54 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  26.84 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  28.57 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  27.43 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.75 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  31.36 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.27 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  27.93 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  27.93 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  24.24 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  26.2 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  24.57 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  23.66 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  25.1 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  24.24 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  23.81 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.71 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.97 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  29.66 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>