65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0580 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  100 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  38.19 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.19 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  32.6 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.8 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  33.9 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.6 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  30.18 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  29.83 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  28.63 
 
 		 241 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  31.9 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  32 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  29.49 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  27.19 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.27 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.45 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.67 
 
 		 237 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  28.88 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  28.26 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  28.57 
 
 		 228 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.91 
 
 		 239 aa  92  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  28.45 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  28.45 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.52 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.13 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  29.44 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  26.27 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  30.68 
 
 		 259 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.42 
 
 		 461 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  26.18 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  30.9 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  26.15 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  29.6 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  28.63 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  26.09 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  30.32 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  28.63 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  28.04 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.69 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  29.79 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  25.54 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.45 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.12 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  27.57 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.59 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  28.32 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.62 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  27.86 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  28.18 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  22.03 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  29.17 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  29.21 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  28.02 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  28.89 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  28.98 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  28.33 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  28.89 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  25.88 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  28.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  26.19 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  30.06 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  28.92 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  27.41 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.48 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>