61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3054 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  34.58 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  35.53 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  31.6 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  29.88 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  34.48 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  35.96 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  33.99 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  30.83 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  33.99 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  32.64 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  31.12 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  32.43 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31.49 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  29.84 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  31.33 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.61 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.53 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  31.68 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  32.55 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  29.65 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  30.13 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  35.44 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.97 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  28.16 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  31.22 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  30.1 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  29.69 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  34.78 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  28.92 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  27.47 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  29.27 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  26.05 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  25.42 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.71 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.18 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.51 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  29.47 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  23.36 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.04 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.37 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  23.53 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.89 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  22.73 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  25.84 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  29 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  25.66 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  25.22 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  25.88 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  25 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  23.04 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  24.68 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  24.24 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.96 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.81 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  23.19 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  22.36 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  22.38 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.38 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>