49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0460 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  100 
 
 		 380 aa  771    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.66 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.32 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  33.5 
 
 		 461 aa  96.7  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.5 
 
 		 266 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.38 
 
 		 258 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  27.04 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  26 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30.53 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  24.37 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  28.41 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  28.12 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.75 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  29.87 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  27.27 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  27.11 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  22.52 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  28.64 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  28.99 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  30.11 
 
 		 229 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  27.14 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25.52 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.43 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  28.65 
 
 		 228 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  23.74 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  26.19 
 
 		 241 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  24.79 
 
 		 238 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  31.54 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  24.2 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  26.19 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  31.54 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  31.54 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.91 
 
 		 239 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  21.61 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  21.24 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  26.7 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  29.27 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  25.9 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  24.89 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  23.39 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  24.5 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  21.68 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  24.55 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  22.38 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  22.11 
 
 		 242 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  21.5 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>