65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1024 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  36.29 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  34.76 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  35.02 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  35.94 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  36.89 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  34.06 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  35.27 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  34.67 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  32.02 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  35.09 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  34.22 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  34.22 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  33.33 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  32.74 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  33.18 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  31.2 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  31.53 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  32.31 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  30.04 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  30.32 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  32.17 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  31.33 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  31.33 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  30.9 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  30.13 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  30.29 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  30.47 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  31.33 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  30.09 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  29.71 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  31.72 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  28.39 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  27.43 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  30.7 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  27.04 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  29.86 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  28.51 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  28.95 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  25.4 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  28.69 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.66 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  26.18 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.67 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.67 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.51 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  25.86 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.57 
 
 		 283 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26.29 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  25.2 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  25.21 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  24.36 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.09 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  26.38 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  25 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  23.87 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  26.75 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.11 
 
 		 259 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  25.75 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.11 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  26.57 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  27.14 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.21 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.27 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>