66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1077 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  98.71 
 
 
234 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  98.71 
 
 
234 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  56.52 
 
 
233 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  53.48 
 
 
236 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  37.71 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  38.53 
 
 
230 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  36.6 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  35.11 
 
 
239 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  35.68 
 
 
259 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  34.26 
 
 
239 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.76 
 
 
264 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  34.51 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  34.22 
 
 
233 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  35.4 
 
 
229 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  34.51 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  31.74 
 
 
244 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  31.9 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  32.05 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  32.2 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  34.65 
 
 
258 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  32.61 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  32.11 
 
 
244 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.45 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  29.79 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.08 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  29.18 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.43 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.26 
 
 
461 aa  85.1  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.54 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.25 
 
 
264 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  26.64 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.51 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  29.49 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.84 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  25.99 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  26.81 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  27.5 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  26.64 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  25.42 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  28.38 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.51 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  26.18 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  26.21 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  25.35 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.14 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  28.93 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  23.81 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  28.43 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  27.92 
 
 
240 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  23.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  25.44 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.13 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  23.95 
 
 
259 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  25.44 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.34 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  23.43 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  25.84 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  23.79 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  31.54 
 
 
380 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  21.85 
 
 
242 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  22.13 
 
 
261 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  20.94 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  23.79 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.74 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>