65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0659 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  100 
 
 
239 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  33.19 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.91 
 
 
244 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  30.64 
 
 
264 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  30.58 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  29.34 
 
 
266 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  30.54 
 
 
251 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  30.54 
 
 
237 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  28.45 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.05 
 
 
240 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.63 
 
 
461 aa  92.8  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.69 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.31 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  29.02 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  24.09 
 
 
264 aa  85.1  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  27.35 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  31.22 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  25.97 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  28.39 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  28.95 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  25.96 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  27.97 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  27.54 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  23.89 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  25.11 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  25.11 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  29.13 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  27.57 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.75 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  26.87 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  24.52 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  26.05 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  24.89 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  24.11 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  23.25 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  26.61 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  24.34 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  27.35 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  22.52 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.09 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.07 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  23.56 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  25.21 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  25.44 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.7 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  25.32 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  23.42 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  23.73 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  22.78 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  22.57 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.72 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  21.68 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  23.48 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  22.88 
 
 
242 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  25 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  24.47 
 
 
244 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.57 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  21.15 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  21.05 
 
 
240 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  21.05 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  22.44 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  23.94 
 
 
240 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>