66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1099 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  62.03 
 
 
239 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  57.2 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  54.89 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  38.96 
 
 
233 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  36.6 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  36.6 
 
 
234 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  36.17 
 
 
234 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  33.77 
 
 
236 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.2 
 
 
229 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  32.89 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  33.48 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.21 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  31.2 
 
 
228 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.96 
 
 
242 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  30.93 
 
 
264 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  28.76 
 
 
259 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.69 
 
 
236 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.39 
 
 
264 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  28.15 
 
 
242 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  30.34 
 
 
244 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.2 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  28.94 
 
 
237 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.26 
 
 
283 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  26.36 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  26.64 
 
 
259 aa  88.6  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.47 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  30 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  25.85 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  25.97 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.23 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  28.75 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  28.63 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  24.26 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.5 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.11 
 
 
461 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  28.33 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  27.85 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  29.33 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  25.91 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  28.27 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  24.14 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  25.21 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  28.22 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  26.58 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  25.94 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.53 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.25 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  24.57 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  25 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  21.89 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  24.57 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.57 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  27.09 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  23.5 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.8 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.64 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.89 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  25.52 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  22.48 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  23.04 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  21.78 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  22.22 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  22.11 
 
 
380 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>