66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3347 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  53.44 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  53.75 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  35.44 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  33.47 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  34.2 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  35.06 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  33.61 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  32.03 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  29.66 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  33.19 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  33.75 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  32.17 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  30.04 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  32.62 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  31.36 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.6 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  30.84 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  30.13 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.65 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.19 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  26.72 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.97 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  29.91 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  29.44 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.96 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  30.5 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  28.76 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.98 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  26.96 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  27.43 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.8 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  31.17 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  29.31 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  25.97 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  27.07 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  26.42 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  26.64 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  27.83 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  29.31 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  29.86 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  29.26 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  29.86 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  29.69 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  24.58 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  27.15 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.94 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.32 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  24.37 
 
 		 380 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  23.53 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  28.51 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  29.29 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  27.91 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  27.71 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  24.03 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  25 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  26.92 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  25.62 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  22.88 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.43 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  22.86 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  23.27 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  20.6 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>