61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1123 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  94.17 
 
 
240 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  93.75 
 
 
240 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  93.33 
 
 
240 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  72.38 
 
 
240 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  72.92 
 
 
240 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  58.58 
 
 
244 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  49.79 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  44.73 
 
 
243 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  41.84 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  43.04 
 
 
233 aa  198  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  42.24 
 
 
238 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  41.95 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  38.82 
 
 
264 aa  175  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  39.42 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  39.5 
 
 
238 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  36.25 
 
 
238 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  35.59 
 
 
241 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.05 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  36.89 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  34.76 
 
 
244 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  30.25 
 
 
242 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  29.49 
 
 
244 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  29.71 
 
 
233 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  28.57 
 
 
245 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  32 
 
 
229 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.9 
 
 
256 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.78 
 
 
258 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  31.09 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  31.94 
 
 
225 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.46 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  29.54 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  23.33 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  33.16 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.39 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.27 
 
 
273 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  31.94 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  30 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.73 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.35 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  28.51 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  28.27 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  28.63 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  27.15 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  26.67 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.21 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.42 
 
 
461 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.32 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.7 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.21 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  27.92 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  25.44 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.89 
 
 
283 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.32 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  25.74 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  26.87 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  24.03 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  22.51 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  22.44 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  21.65 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>