64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2545 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2545  SapC  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  40.83 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  39.92 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  40.34 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  38.2 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  39.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  39.92 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  38.24 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  38.03 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  33.89 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  36.97 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.19 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  33.89 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  33.75 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  34.31 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  36.91 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  31.49 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  32.33 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  33.33 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  32.33 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  31 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  32.5 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  31.33 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.6 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  28.82 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  29.81 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  30.95 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  31.95 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  31.33 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  28.81 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.19 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  31.9 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  33.18 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.46 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  26.92 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  28.83 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.69 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  28.07 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.39 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  28.19 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  29.6 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  28.83 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.93 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  27.68 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  26.84 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.2 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  29.33 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.52 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.59 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  25.41 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  23.61 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.7 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  24.57 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.18 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  26.18 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  23.25 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  27.19 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  27.04 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  24.14 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  25.83 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  25.36 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  22.57 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>