More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0658 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  100 
 
 		 513 aa  1028    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  47.28 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  49.9 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  48.03 
 
 		 506 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  50.49 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  48.03 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  49.9 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  49.71 
 
 		 507 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  47.24 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  30.59 
 
 		 551 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  27 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  27.96 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  25.87 
 
 		 573 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  26.13 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  24.69 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.6 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.4 
 
 		 552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  27.34 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  26.18 
 
 		 561 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  26.64 
 
 		 579 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  25.75 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  27.32 
 
 		 561 aa  130  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  25.7 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.73 
 
 		 560 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  26.08 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  26.48 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  26.25 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  25.7 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  26.25 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  25.49 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  26.25 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  26.08 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  26.25 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  26.56 
 
 		 567 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  25.74 
 
 		 580 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  25.52 
 
 		 566 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  26.46 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  24.35 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  24.87 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 578 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  25.27 
 
 		 551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  27.29 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 559 aa  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  26.25 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  26.93 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  27.4 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  26.78 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  26.39 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  23.39 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  25.95 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  24.19 
 
 		 559 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  24.51 
 
 		 551 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  24.19 
 
 		 559 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  23.02 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  24.47 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  27.59 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  24.53 
 
 		 581 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  24.3 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  27.44 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  23.58 
 
 		 556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  26.46 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  24.44 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  25.87 
 
 		 559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  22.67 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  27.4 
 
 		 551 aa  113  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  24.77 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  23.81 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  25.7 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  23.86 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 554 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  23.21 
 
 		 557 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  24.51 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  25.54 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  23.48 
 
 		 565 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  24.48 
 
 		 588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  24.17 
 
 		 553 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  23.5 
 
 		 567 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 		 588 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  24.83 
 
 		 558 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  24.42 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  23.37 
 
 		 554 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  22.69 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  30.62 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  24.66 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  24.6 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.51 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  25.55 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  25.65 
 
 		 558 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  24.87 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>