More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1000 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 502 aa  986    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.74 
 
 		 565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  30.87 
 
 		 561 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  30.17 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1866  SMC domain-containing protein  33.03 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  28.5 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 580 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 		 566 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.05 
 
 		 570 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  26.08 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  27.58 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  30.6 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  27.58 
 
 		 554 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  27.37 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 560 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  30.5 
 
 		 588 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  27.36 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  29.9 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 		 585 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  26.4 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  26.4 
 
 		 575 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 588 aa  186  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 585 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  27.03 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  27.21 
 
 		 608 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  26.91 
 
 		 564 aa  183  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 556 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  26.04 
 
 		 549 aa  183  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  27 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  28.19 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  27.04 
 
 		 567 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  26.52 
 
 		 563 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.45 
 
 		 567 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  27.36 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  27.08 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  26.6 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 572 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  26.19 
 
 		 599 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.99 
 
 		 551 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  28.39 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  27.27 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  27.08 
 
 		 557 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  27.14 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  28.68 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  27.45 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  26.62 
 
 		 574 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  28.06 
 
 		 565 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  26.16 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  25.85 
 
 		 601 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  26.06 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.13 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  26.44 
 
 		 594 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  26.91 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  26.73 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  26.73 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 		 552 aa  171  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  28.26 
 
 		 553 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  25.8 
 
 		 565 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  27.39 
 
 		 559 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  27.39 
 
 		 559 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  24.91 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  27.82 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.07 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  26.9 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  27.01 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  26.5 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  26.56 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  26.32 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  25.09 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  26.34 
 
 		 572 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  26.32 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  26.32 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  27.76 
 
 		 578 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  26.57 
 
 		 558 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  27.97 
 
 		 537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  28.31 
 
 		 543 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  27.76 
 
 		 555 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  28.49 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  23.91 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  24.68 
 
 		 553 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  24.91 
 
 		 553 aa  166  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  25.92 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  26.12 
 
 		 580 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  26.42 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  26.13 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  26.36 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  26 
 
 		 554 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  26.13 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  28.6 
 
 		 555 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  25.86 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  25.86 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>