More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1084 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1084  ATPase  100 
 
 		 513 aa  1007    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  47.28 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  48.11 
 
 		 501 aa  425  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  48.53 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  44.77 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  45.69 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  44.38 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  46.08 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.23 
 
 		 566 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  31.37 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  26.62 
 
 		 551 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  28.17 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  27.19 
 
 		 551 aa  144  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  28.75 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  25.27 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  26.12 
 
 		 554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  26.13 
 
 		 552 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  24.61 
 
 		 575 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  26.02 
 
 		 572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  26.97 
 
 		 559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  26.97 
 
 		 559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  23.75 
 
 		 556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  25.6 
 
 		 578 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  24.11 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  23.94 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 567 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  29.23 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  27.27 
 
 		 555 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  22.24 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  22.24 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  23.73 
 
 		 553 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.28 
 
 		 560 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  23.92 
 
 		 593 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  23.98 
 
 		 555 aa  123  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  24.78 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  26.5 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  26.86 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  23.67 
 
 		 549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  25.64 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.5 
 
 		 579 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  24.15 
 
 		 574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  25.65 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  24.6 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  24.6 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  24.6 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  24.02 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  24.31 
 
 		 573 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  26.32 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  26.78 
 
 		 592 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.75 
 
 		 552 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  25.42 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  22.4 
 
 		 608 aa  120  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 583 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  23.63 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  22.07 
 
 		 580 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  22.4 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  22.98 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  26.32 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  26.42 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  26.32 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  26.35 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  26.32 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  22.7 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  25.64 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0899  SMC domain protein  23.15 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000574195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  21.9 
 
 		 570 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  25.61 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  23.42 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  22.3 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  23.21 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  22.3 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  25.32 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  23.78 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  25.44 
 
 		 574 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  23.99 
 
 		 556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  22.49 
 
 		 553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  24.04 
 
 		 549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  24.6 
 
 		 554 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  23.23 
 
 		 591 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  22.32 
 
 		 553 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  22.32 
 
 		 553 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  21.21 
 
 		 557 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  22.32 
 
 		 553 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  22.32 
 
 		 553 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  23.34 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  23.82 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  23.12 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  23.12 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  23.12 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  23.12 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  23.64 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  24.25 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  21.95 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>