More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0899 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0899  SMC domain protein  100 
 
 
540 aa  1073    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000574195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  32.66 
 
 
554 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  28.17 
 
 
551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 
558 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  29.18 
 
 
556 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  27.56 
 
 
553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  27.38 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  27.38 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  27.96 
 
 
553 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 
574 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  30.21 
 
 
560 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  29.36 
 
 
568 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 
554 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  28.73 
 
 
559 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  25.92 
 
 
566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  26.11 
 
 
555 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.03 
 
 
579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  28.77 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  28.07 
 
 
567 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  26.09 
 
 
579 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 
559 aa  179  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.09 
 
 
579 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  26.77 
 
 
608 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  30.07 
 
 
558 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  25.91 
 
 
583 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  26.09 
 
 
579 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 
559 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  26.09 
 
 
579 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  26.77 
 
 
556 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 
559 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  25.91 
 
 
583 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  25.83 
 
 
555 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 
557 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  31.54 
 
 
583 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 
579 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 
580 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 
559 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  30.39 
 
 
558 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  28.42 
 
 
574 aa  177  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  25.91 
 
 
579 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  28.83 
 
 
568 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  25.91 
 
 
579 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  30 
 
 
559 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 
553 aa  176  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  29.63 
 
 
557 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  27 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 
547 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.09 
 
 
551 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  27.93 
 
 
554 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  29.56 
 
 
569 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  27.19 
 
 
572 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  28.96 
 
 
579 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  26.95 
 
 
553 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  26.95 
 
 
553 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  26.95 
 
 
553 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 
552 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  26.95 
 
 
553 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  26.95 
 
 
553 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  26.96 
 
 
553 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.04 
 
 
580 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.88 
 
 
554 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  28.62 
 
 
553 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  26.95 
 
 
553 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  29.63 
 
 
557 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  29.35 
 
 
572 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  25.31 
 
 
555 aa  171  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 
557 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.32 
 
 
558 aa  170  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  26.95 
 
 
553 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 
553 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 
549 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  29.61 
 
 
549 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  27.83 
 
 
555 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  26.06 
 
 
557 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 
557 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 
589 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 
549 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  26.82 
 
 
557 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 
558 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  26.87 
 
 
532 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 
549 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  29.33 
 
 
557 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  28.6 
 
 
561 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 
549 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 
579 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  26.57 
 
 
561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  29.68 
 
 
558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  29.9 
 
 
558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  29.45 
 
 
557 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  28.18 
 
 
554 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  26.77 
 
 
553 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  28.06 
 
 
555 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  28.34 
 
 
557 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  29.34 
 
 
579 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  26.63 
 
 
559 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  27.13 
 
 
553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  27.01 
 
 
553 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  25.82 
 
 
565 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>